Историята на Ханти-Мансийската държавна медицинска академия започва през 1994 г., когато с указ на ръководителя на администрацията на Ханти-Мансийския автономен окръг A.V. Филипенко в град Ханти-Мансийск е създаден от окръга Медицински колежв Тюменския държавен медицински институт за обучение на специалисти за бързо развиващата се здравна система на автономния окръг. През 1999 г. на базата на колежа, със заповед на губернатора на областта, е създаден Ханти-Мансийският държавен медицински институт. През 2001 г. институтът получава лиценз от Министерството на образованието Руска федерацияза правото на поведение образователни дейностивъв висшето образование професионално образованиеспециалност 040100 - Обща медицина и допълнително образование.
През 2004 г. Федералната служба за надзор в образованието и науката на Руската федерация Ханти-Мансийски държавен медицински институт, въз основа на резултатите от цялостна оценка на дейността на университета, беше призната за преминала държавна акредитация по специалност висше професионално образование 040100 - Обща медицина. Откриха се следдипломни обучения по специалностите на учените 14.00.05 - Вътрешни болести, 14.00.27 - Хирургия, стаж и клинична ординатура по хирургия, вътрешни болести, акушерство и гинекология. Дейностите на университета в областта на обучението на медицински кадри, изследователската и диагностичната работа бяха признати за успешни.

През 2005 г. институтът е реорганизиран чрез присъединяването му към най-старата образователна институция на автономния окръг - медицинско училище. Медицинското училище е открито през 1934 г. с решение на Народния комисариат по здравеопазването на RSFSR в град Остяко-Вогулск (сега Ханти-Мансийск) като фелдшерско-акушерско училище за обучение на медицински персонал от коренното население на Севера (ханти, манси, коми, селкупи). По време на присъединяването си към института училището обучава фелдшери, медицински сестри, акушерки, лаборанти.

През октомври 2009 г. в Ханти-Мансийския държавен медицински институт Агенцията за обществен контрол на качеството на образованието и кариерното развитие (AKKORK) проведе проверка на основните образователни програмиизпълнявани от института, програми за допълнително професионално образование, както и условията за тяхното прилагане, включително оценка на резултатите от образователни, методически и изследователски дейности. Резултатите от проверката показаха, че Институтът за 5-те години, изминали от цялостната оценка на дейността на университета през 2004 г., е постигнал значителен напредък, значително надхвърляйки праговите стойности на показателите държавна акредитацияакадемия. Основният показател за работата на всяка образователна институция е качеството на обучението. Резултатите от компютърното тестване на студентите от Медицинския факултет по основна образователна програма 060101.65 – Обща медицина по 5 дисциплини показаха показатели над прага, което показва достатъчно качество на учебния процес днес. 19% от студентите на медицинския факултет участват в изследователска работа в института. Институтът постигна значителен напредък в изследователската работа, което до голяма степен се дължи на политиката на правителството на Ханти-Мансийския автономен окръг, която има за цел да укрепи материалната база на университетите, разположени в окръга, и разпределянето на средства чрез конкурентната система за регионални стипендии за научни изследвания, стимулиране на обучението на научни и педагогически кадри, писане и публикуване на монографии. Това даде възможност за значително интензифициране и подобряване на ефективността научна работаВ института. Научните изследвания в академията се извършват в рамките на 3 клона на науката: медицински, биологични, социални и хуманитарни. Въз основа на резултатите от научните изследвания през последните 5 години са защитени 6 докторски и 15 магистърски дисертации, спечелени са 18 стипендии, получени са 8 патента за изобретения, публикувани са 18 монографии. Така през изминалия период в института са защитени средно 6,2 кандидатски и докторски дисертации на 100 души научен и научно-педагогически персонал годишно, подготвени и публикувани са 7,5 монографии на 100 основни щатни преподаватели с научни степени и заглавия. Ефективността на следдипломната квалификация, открита през 2004 г., е 100%, което означава защита на следдипломни дисертации не по-късно от 1 година след завършване на следдипломна квалификация. Делът на висококвалифицираните специалисти с степении титли, в състава на преподавателския състав, участващ в изпълнението на програмите за висше професионално образование, възлизат на 69%, включително 17,9% - доктори на науките и професори, редица служители имат почетни звания "Заслужил деец на науката и образованието на Руска федерация“, „Почетен лекар на Руската федерация“, „Почетен изобретател на Руската федерация“. 86,7% от преподавателите работят в института на пълен работен ден при прагова стойност от 50,0%. Значително е укрепена материалната база на университета - през 2008 г. е пусната в експлоатация нова учебна сграда с обща площ около 8000 кв. м, модерно лабораторно и учебно оборудване, учебно-методически и научна литература.
През декември 2009 г., въз основа на резултатите от проверката на образователните програми, изпълнявани от института, качеството на обучението на завършилите Федерална службапо надзор в областта на образованието и науката институтът е акредитиран като държавен образователна институциявисше професионално образование със създаване на тип "академия", а през м. февруари 2010 г. е признато за преминало проверката на условията за осъществяване на учебния процес с издаване на лиценз за право на извършване на учебна дейност до януари 1, 2015 г. с установяване на максимален брой ученици, намалени в редовна форма на обучение, 1016 Човек.

В момента Държавната образователна институция за висше професионално образование на Ханти-Мансийския автономен окръг - Югра "Ханти-Мансийска държавна медицинска академия" е регионален университет, чийто основател е Ханти-Мансийският автономен окръг - Югра, правомощията на основател се извършват от Министерството на образованието и науката на автономния окръг.

В структурата на академията има три факултета: медицински, средно медицинско професионално образование, следдипломно обучение, обединяващи 31 катедри, които осигуряват обучение на специалисти по програми за висше професионално образование: 060101.65 - Обща медицина; средно професионално 060101.52 - Медицина, 060102.51 - Акушерство, 060109.51 - Медицинска сестра, 060110.51 - Лабораторна диагностика; стажантски и резидентски програми по специалностите "акушерство и гинекология", "терапия", "хирургия", "онкология", професионална преквалификация и повишаване на квалификацията на специалисти с висше и средно медицинско образование в профила на основните образователни програми на университета. Висшето училище на академията обучава научни и педагогически кадри по следните специалности: 03.01.04 Биохимия, 03.03.01 Физиология, 03.03.04 Клетъчна биология, Цитология, Хистология, 14.01.04 Вътрешни болести, 01 /14/12 Онкология, 14.01.17 Хирургия.

Днес академията разполага с 2 учебни сгради, в които са разположени катедрите по медико-биологични, природни науки, социални и хуманитарни профили, учебни и научни лаборатории, компютърни класове, столова, спортна зала. Клиничните отделения са разположени в модерни медицински и превантивни институции на град Ханти-Мансийск, оборудвани с най-новото високотехнологично диагностично и лечебно оборудване: Окръжна клинична болница, Окръжна клинична болница за рехабилитация и Областни специализирани диспансери. В общи линии учебен процесорганизирани в сгради и помещения с площ над 13 хиляди квадратни метра, които включват 15 лекционни зали, 56 кабинета за практически и лабораторни занятия, библиотека с общ фонд над 40 хиляди екземпляра, спортна зала . Общият брой използвани компютри в учебен процес 395, включително 4 компютърни класа за 60 персонални компютъра, обединени в локална мрежа, 105 работни места имат достъп до Интернет.

В академията учат повече от 700 студенти, повечето от които са жители на автономния окръг. Наблюдава се увеличение на студентите, идващи да учат от други региони на Русия, предимно от градовете на Уралския и Сибирския федерален окръг. Конкурсът за прием в университет въз основа на резултатите от приемните изпити през последните 5 години е средно над 4 души за медицинския факултет, повече от 2 души за едно място за факултета за средно медицинско професионално образование. Студентите активно придобиват професионални знания, участват в изследователска работа, представят научни доклади на общоруски, регионални междууниверситетски научни конференции, публикуват резултатите от своята работа в сборници и научни периодични издания.
Днес Ханти-Мансийската държавна медицинска академия е млад, активно развиващ се регионален университет, който осигурява висококачествено обучение на специалисти в диапазона от висши, средни, следдипломни професионални медицинско образованиеза здравеопазването на автономния окръг. Основният показател за ефективността на Академията и нейната гордост са нейните възпитаници, по-голямата част от които успешно работят по специалността си в медицинските институции на Ханти-Мансийския автономен окръг - Югра.

Забележителна характеристика на това класиране е значителната плътност на резултатите и високият среден USE резултат, с който студентите са влезли медицински училища. Достатъчно е да се каже, че повече от 35 университета имат USE резултат над 70, което предполага поне сериозен конкурентен подбор и популярност на тези учебни заведения сред кандидатите.

Що се отнася до самия рейтинг, той се ръководи от Воронежката държавна медицинска академия на името на I.I. Н.Н. Бурденко. Малко зад нея Санкт Петербургски държавен медицински университет. Академик И.П. Павлова (81,6) и Кубанския държавен медицински университет (81,4), които заеха съответно второ и трето място. Челната десетка е представена и от още 5 регионални и 2 столични университета.

№ п / стр	Името на университета	Среден USE резултат	Мин. USE резултат	% на общ бройкандидати, приети на бюджет чрез конкурса за ЕГН
1	Воронежска държавна медицинска академия на името на V.I. Н.Н. Бурденко	82,5	75,5	48,2
2	Държавен медицински университет в Санкт Петербург. Академик И.П. Павлова	81,6	69,8	56,6
3	Кубански държавен медицински университет, Краснодар	81,4	74,7	43,6
4	Ставрополска държавна медицинска академия	80,9	75,1	42,3
5	Московска медицинска академия. ТЯХ. Сеченов	79,8	64,2	76,8
6	Дагестанска държавна медицинска академия, Махачкала	79,7	72,4	67,1
7	Башкирски държавен медицински университет, Уфа	78,8	71,6	34,8
8	Московски държавен университет по медицина и стоматология	78,7	65,8	65,2
9	Рязански държавен медицински университет. Академик И.П. Павлова	78,3	73,3	40,6
10	Смоленска държавна медицинска академия	78,2	71,8	52
11	Държавна медицинска академия в Нижни Новгород	78,2	76,9	39,7
12	Красноярски държавен медицински университет. Професор В. Ф. Войно-Ясенецки	77,7	72,2	44,6
13	Волгоградски държавен медицински университет	76,9	72,8	68,9
14	Казански държавен медицински университет	76,8	67,3	45,3
15	Тверска държавна медицинска академия	76,7	72,4	47,1
16	Самарски държавен медицински университет	76,4	64,3	50,8
17	Уралска държавна медицинска академия, Екатеринбург	75	72,1	72,1
18	Астраханска държавна медицинска академия	74,9	67,6	63,2
19	Ярославска държавна медицинска академия	74,8	69,5	45,8
20	Саратовски държавен медицински университет	74,7	69,1	54,1
21	Ивановска държавна медицинска академия	74,6	72,6	57,4
22	Държавна педиатрична медицинска академия в Санкт Петербург	74,5	59,5	76,6
23	Ижевска държавна медицинска академия	74,4	70,4	58,3
24	Държавна химико-фармацевтична академия в Санкт Петербург	74,4	67,3	90,2
25	Алтайски държавен медицински университет, Барнаул	74,3	70,7	41
26	Челябинска държавна медицинска академия	74,3	69,4	75,2
27	Ростовски държавен медицински университет, Ростов на Дон	74,1	69,9	55,7
28	Новосибирски държавен медицински университет	74	68,6	56,7
29	Оренбургска държавна медицинска академия	73,7	66,4	62,1
30	Кировска държавна медицинска академия	73,6	69,4	48,6
31	Омска държавна медицинска академия	73,4	71,7	45,1
32	Сибирски държавен медицински университет, Томск	73,1	65,9	63,1
33	Москва държавна академияветеринарна медицина и биотехнологии им. К.И. Скрябин	72,4	72,5	20,8
34	Тюменска държавна медицинска академия	70,4	70,7	26,6
35	Държавна медицинска академия в Чита	70	71,1	45
36	Пермска държавна фармацевтична академия	70	59	80
37	Иркутски държавен медицински университет	69,8	64,8	50,9
38	Курск държавен медицински университет	69,7	60,5	54,2
39	Държавен медицински институт Ханти-Мансийск	69,4	64,3	70,7
40	Държавна медицинска академия в Санкт Петербург. И.И. Мечников	69,3	58,8	50,9
41	Северен държавен медицински университет, Архангелск	69,1	62,8	68,3
42	Далекоизточен държавен медицински университет, Хабаровск	68,9	64,3	48,4
43	Руски държавен медицински университет, Москва	68,3	50,4	72,1
44	Кемеровска държавна медицинска академия	67,7	50,9	82,7
45	Пятигорска държавна фармацевтична академия	66,9	40,3	85,2
46	Пермска държавна медицинска академия	66,2	55,9	68,2
47	Амурска държавна медицинска академия, Благовещенск	61,5	51,7	87
48	Владивостокски държавен медицински университет	60,5	52,3	78,7
49	Държавна академия по ветеринарна медицина в Санкт Петербург	60,3	45	89,8
50	Уралска държавна академия по ветеринарна медицина, Троицк	51,7	34,1	88,3